Флаг Министерства Обороны учрежден Указом Президента Российской Федерации от 21 июля 2003 г.

Флаг Министерства Обороны РФ к представляет собой четырехконечный крест белого цвета с расширяющимися концами и с равноразделенными красно-синими углами . Красные половины углов примыкают к вертикальным концам креста. В центре полотнища изображен военный геральдический знак - эмблема Министерства обороны Российской Федерации.

Отношение ширины флага к его длине - 2:3.