Флаг района Южное Медведково представляет собой двустороннее, прямоугольное полотнище с соотношением сторон 2:3. Полотнище состоит из двух равновеликих горизонтальных полос - верхней красной и нижней желтой. В центре красной полосы помещено изображение желтого солнца. В центре желтой полосы помещено изображение идущего к древку бурого медведя.
Флаг района Южное Медведково построен по принципу "гласности". Идущий бурый медведь символизирует топоним "Медведково". Вместе с красным цветом верхнего поля медведь является символом мужества и героизма прославленных защитников Москвы под предводительством князя Д.М.Пожарского, правнука В.Ф.Пожарского по прозвищу Медведь - первого владельца земель, на территории которых расположено современное муниципальное образование. Золотое солнце и золотое нижнее поле символизируют топоним "Южное".
Южное Медведково - новый район столицы (образован, как и Северное Медведково, в 1991 году), но с древней историей. Первым владельцем этой земли был князь Василий Федорович Пожарский, по прозвищу Медведь. Самые ранние официальные упоминания о Медведкове сохранились в писцовых книгах 1623-1624 годов как о владении потомка Василия Федоровича, князя Дмитрия Михайловича Пожарского, воеводы общенародного ополчения 1612 года.
Основные сведения об истории Медведкова изложены в справке о районе Северное Медведково; здесь добавим некоторые подробности.
В 1634-1635 годах князь Дмитрий Пожарский осуществляет обет, данный Богородице накануне сражения с польско-литовскими захватчиками: воздвигает на месте бывшей деревянной церкви каменный храм во имя Богородицы. Медведковский храм - последний в московском зодчестве одношатровый, ибо в 1652 году патриарх Никон положил запрет на строительство таких храмов, как не соответствующих церковному канону.
В период семилетнего регентства царевны Софьи (с 1682 года) у Медведкова появляется новый хозяин - крупнейшая политическая фигура тогдашней России, фаворит царевны Софьи, князь Василий Васильевич Голицын. Около двух лет владея Медведковом, Голицын вложил много сил и средств в обустройство усадьбы.
В 1689 году, с провалом стрелецкого бунта, опала настигла и Софью, и ее любимца. Повелением Петра I Василий Голицын и его старший сын были отправлены из Медведкова в Троице-Сергиев монастырь, где им прочитали указ о лишении всех чинов и привилегий. Медведково перешло в государево владение. В 1691 году Петр I пожаловал его своему дяде, Федору Кирилловичу Нарышкину. В течение всего XVIII века эта земля принадлежала семье Нарышкиных, а в XIX веке имение не раз меняло владельцев.
Строительство Северной Ярославской железной дороги способствовало тому, что Медведково стало популярным дачным местом, где москвичи снимали под дачи крестьянские дома. В советское время дачное место все более обретало черты города, постепенно становясь органичной его частью.
Ныне это благоустроенный район города с большими перспективами.