Флаг Молдавии принят 12 мая 1990 г.
В 1940 г. Бессарабия и Буковина, составляющие значительную часть исторической Молдавии, были отторгнуты от Румынии и присоеденнены к Советскому Союзу в качестве Молдавской ССР. Стремясь к независимости и в переспективе к объединению с Румынией, молдавские власти приняли за основу флаг Румынии, добавив свой государственный герб (орел Валахии и щит Молдавии).