Герб Аткарского муниципального образования воспроизводит исторический, пожалованный в 1780 году герб города Аткарска; согласно Указу о пожаловании, в гербе изображены «река, по которой в серебряном поле три летящие рыболова, каковых птиц в окрестностях сего города пребезмерно много».

Геральдическое описание Герба муниципального образования Аткарского района гласит: «В серебре пониженный противоволнистый лазоревый (синий, голубой) пояс, сопровождаемый во главе тремя летящими вправо, с распростертыми крыльями, черными птицами - рыболовами. В левой вольной части - герб Саратовской области (три положенные в вилообразный крест, сообращенные серебряные стерляди в лазоревом поле)». Поворот геральдически вправо, упоминаемый в описании, соответствует повороту влево от зрителя.