Герб города Бабушкин республики Бурятия утвержден решением Совета руководителей города Бабушкина от 30 августа 2002 года.

До 1941 г. город назывался Мысовск, исторический герб города утвержден 26 апреля 1913 года: "В червленом поле на серебряной воде черное судно с тремя золотыми цибиками (ящиками с чаем). В вольной части щита герб Забайкальской области. Щит увенчан червленой стенчатой короной, за щитом накрест положены два золотых якоря, перевязанных Александровской лентой."

В червлёном поле на серебряной волнистой оконечности чёрная ладья с таковым же рулем, нагруженная тремя (два и один) крестообразно перевязанными золотыми тюками.

Обоснование символики: 
За основу герба города Бабушкина взят исторический герб города Мысовска, Забайкальской области, утверждённый 26 апреля 1913 года, подлинное описание которого гласит: "В червленом поле на серебряной воде черное судно с тремя золотыми тюками груза. В вольной части герб Забайкальской области". 
Современный город Бабушкин, (переименованный в 1941 г. в честь революционера И.В. Бабушкина, расстрелянного в 1906 г.), расположенный на южном берегу озера Байкал, был основан в 1882 г. как почтовая станция Мысовая, начальный пункт торгового пути в Монголию и Китай - что и показано в гербе ладьей, нагруженной тюками. 
Черный цвет в геральдике символизирует благоразумие, мудрость, свободу, покой и мир. 
Золото в геральдике символизирует богатство, справедливость, уважение, великодушие 
Серебро в геральдике - символизирует совершенство, благородство, чистоту, веру, мир. 
Красный цвет в геральдике символизирует храбрость, мужество, красоту.