Возник город как приисковая резиденция по складу грузов в 1864 году для обслуживания золото промыслового Ленского района. В 1903 году Николай II дал указ о присвоении Бодайбинской резиденции городского статуса.

Начиная с 1894 года по 1967 год, город являлся отправной станцией Бодайбинской железной дороги. В 1912 году на приисках золота произошла крупнейшая забастовка, законченная расстрелом бунтующих. Свое значительное развитие город получил в советское время. В 1980 – е годы второй по значимости отраслью после золотодобычи стала строительная отрасль.

Современное время

Сегодня Бодайбо является административным центром крупного промышленного района. Именно здесь сосредоточены главные базы и офисы сервисных и золотодобывающих предприятий, учреждения культуры, общеобразовательные организации, учреждения культуры и транспорта.

В настоящее время экономика города неразрывно связана с добычей золота, менее развиты такие отрасли, как производство стройматериалов и пищевая промышленность.

Благодаря усилиям горожан, золотопромышленникам и муниципальной власти в городе обустраиваются дворы и улицы, возводятся социальные объекты и создаются все необходимые для комфортной жизни населения условия.