Флаг Щелковского района представляет собой  прямоугольное двустороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, разделенное на две части: меньшую синюю, расположенную у древка и занимающую 1/3 длины полотнища, и большую красную, и несущее на границе цветов в середине изображение фигур герба белого цвета в 2/3 ширины полотнища.

Флаг Щёлковского муниципального района разработан на основании герба района. Автор герба и флага художник Виктор Пальчиков (Щёлково), геральдическая доработка — Константин Мочёнов (Химки).

Утвержден решением Совета депутатов Щёлковского муниципального района от 25.05.2010 № 78/11