Флаг г. Искитима представляет собой прямоугольное полотнище зелёного цвета, несущее в середине изображение двух жёлтых противостоящих бобров, держащих в передних лапах перед собой белый мастерок. Внизу полотнища проходит синяя волнообразная полоса, занимающая 1/5 ширины флага. Отношение ширины флага к его длине — 2:3".
Флаг города Искитима разработан на основе герба города Искитима.
Зелёный цвет — символ надежды, изобилия, возрождения, жизненных сил, олицетворяет красоту сибирской природы.
Синий (голубой) цвет — символ благополучия, мира, верности, движения вперёд.
Волнообразная оконечность символизирует реку Бердь, на берегах которой расположен город Искитим.
Жёлтый цвет (золото) — символ радушия, гостеприимства, справедливости, больших запасов полезных ископаемых — «золотых» недр, являющихся одним из основных источников богатства и благополучия жителей города.
Белый цвет (серебро) — символ веры, чистоты, искренности, благородства, преданности избранному делу.
Бобры, держащие строительный мастерок и девиз «СТРОЯЩИЙ ГОРОДА», символизируют градообразующую строительную индустрию города Искитима, в котором основная доля выпускаемой продукции приходится на производство строительных материалов. Строительство в 1930 году крупнейшего в Сибири Чернореченского цементного завода стало одним из основных факторов, определивших возникновение и быстрое развитие города Искитима.
Бобры символизируют трудолюбие, целеустремлённость и стойкость жителей города.