Флаг города Козельск Калужской области представляет собой прямоугольное двухстороннее полотнище алого цвета с отношением ширины к длине 2:3, несущее изображение фигур из герба города Козельск: пять обремененных черным греческим (равноконечным отвлеченным) крестом белых фигурных тарча (2-1-2) перемежаемых четырьмя желтыми греческими крестами.

За основу герба муниципального образования "город Козельск" взят исторический герб города Козельска Калужской губернии, утвержденный 10 марта 1777 года, подлинное описание которого гласит: "Во время нахожденiя Батыя въ Россiю, сей градъ бывъ удъломъ малолътняго Князя Василiя Титыча, былъ осажденъ Татарскими войсками, и хотя малолътство Князя являлося бы долженствовать ослабить его жителей, но върность ихъ къ Государю, превозмогая въ нихъ всъ другiе чувствiя, они разсудили сдълать вылазку и обще съ Княземъ погибнуть или спастися. Сiе ими исполнено было, но отъ превосходящаго числа Татаръ были всъ побиты. Въ напоминанiе сего приключенiя, въ гербъ имъ полагается: въ червленомъ полъ, знаменующимъ кровопролитiе, на крестъ расположенные пять серебряныхъ щитовъ съ черными крестами - являющiе храбрость ихъ защинiя и несчастную судьбину - и четыре златые креста - показующiе ихъ върность".
Красный цвет - символ мужества, красоты, жизни. Черный цвет в геральдике символизирует благоразумие, мудрость, скромность, честность и вечность бытия.
Серебро в геральдике - символ чистоты, мудрости, благородства, мира, взаимосотрудничества.
Золото - символ богатства, величия, прочности, интеллекта и прозрения.