Флаг города Нестеров Калининградской области представляет собой прямоугольное полотнище, разделенное по горизонтали на белый и зелёный цвета с соотношением сторон 2:3, и воспроизводящее в центре композицию герба района. Расстояние до ножек стола составляет 1/8 от нижнего края полотнища и от верхнего края полотнища до основания зубцов ворот 1/16 ширины полотнища флага. Символика флага района воспроизводит символику герба района.