Прямоугольное голубое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее изображение трёх белых водяных лилий из герба городского округа Новокуйбышевск.

Обоснование символики: 
Флаг городского округа разработан на основе герба городского округа, который языком символов и аллегорий отражает исторические и природные особенности города; 
Новокуйбышевск - молодой город, получивший свой статус в 1952 году. Он был образован при строительстве нефтеперерабатывающего завода. Основой города стали три села Русские Липяги, Мордовские Липяги и Чувашские Липяги, аллегорически отражённые в герое цветками водной лилии - символа молодости, красоты, расцвета жизни: 
серебро в геральдике- символ совершенства, чистоты, мира и взаимопонимания; 
синий цвет поля дополняет символику и указывает на географическое расположение городского округа Новокуйбышевск на берегах реки Волги; 
синий цвет в геральдике символизирует духовность, честь, славу, водные просторы и чистое небо.