Флаг поселка Понтонный Ленинградской области представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длине - 2:3, воспроизводящее композицию герба МО поселок Понтонный в красном, синем и желтом цветах.

Обоснование символики:
Золотой якорь с перекрещенными поверх него двумя такими же топорами - эмблема на погонах понтонных батальонов инженерных войск русской армии в 1909-1917 гг.
Золотые ромбы (листы фанеры) символизируют Усть - Ижорский фанерный комбинат , основанный в 1910 г.
Ромбы можно рассматривать как символическое изображение понтонов.
Якорь - это и символ Усть-Ижорской судоверфи, заложенной Морским ведомством России на земле, которая была выкуплена в 1912 г. у крестьян села Вознесенское.
Лазоревый столб - символ реки Невы.
Золото- могущество, сила, постоянство, вера, справедливость, добродетель, верность.
Лазоревый - слава, честь, верность, искренность, безупречность.
Червлень - символ боевой и трудовой славы, честь, энергию и огонь промышленного производства. Сила, могущество, благородство, право, мужество храбрость, неустрашимость. Геральдический цвет Санкт-Петербурга.

Утвержден Решением Муниципального Совета МО поселок Понтонный (#68/157-1) от 17 мая 2007 года.