Обоснование символики 
Северо-Курильский район расположен на северных островах Большой Курильской гряды, омываемых Охотским морем и Тихим океаном. Водные просторы, играющие особую роль в жизни местного населения (в Северо-Курильске находится база дальневосточного сейнерного флота), отражены на флаге синим и белым цветами. 
На территории района находится заказник с многочисленными стадами каланов, что отражено на флаге. 
Настороже — в геральдике поза животного повёрнутого в геральдическую правую сторону (влево от зрителя), а головой обращённого прямо (на зрителя). 
Раковины символизируют добычу морского гребешка — один из основных видов хозяйственной деятельности района в рыболовно-добывающей и перерабатывающей отрасли. Также раковины являются аллегорией островов, на которых расположен район. В геральдике раковина — символ человеческой духовности и благополучия, красоты, гармонии и вечности. 
Синий цвет — символ возвышенных устремлений, мышления, искренности и добродетели. 
Жёлтый цвет (золото) — символ высшей ценности, прочности, силы, великодушия, солнечного света и рассвета. 
Белый цвет (серебро) — символ простоты, совершенства, благородства, мира, взаимосотрудничества.