Флаг города Северск (Томск-7) Томской области представляет собой прямоугольное полотнище с соотношением ширины флага к его длине - 2:3. 
Фон полотнища белый, что соответствует цвету поля герба ЗАТО Северск. В центре полотнища размещен шар, окруженный пятнадцатью скрещивающимися вытянутыми кольцами, собранными по пять, и оливковым венком. Все фигуры синие. 
Обратная сторона флага зеркально повторяет его лицевую сторону.

Обоснование символики: 
Шар и окружающие его скрещивающиеся кольца составляют символический стилизованный знак атома, который служит эмблемой атомного производства, благодаря которому был создан город Северск, а затем – закрытое административно-территориальное образование Северск. 
Оливковые ветви (символ мира), обрамляя центральную фигуру, указывают на созидательный, мирный характер атомного производства, говорят о победе человека, подчинившего себе атом. 
Лазоревый (синий) цвет геральдических фигур говорит о красоте и молодости ЗАТО Северск, величии труда его жителей. 
Серебряное (белое) поле, в котором размещена композиция, - символ мира, невинности и чистоты.