Флаг города (района) Сковородино Амурской области представляет собой желтое полотнище с соотношением ширины к длине - 2:3, несущее вдоль нижнего края две полосы по 2/15 ширины полотнища каждая; верхняя полоса составлена из 5 чередующихся белых и черных частей, а нижняя полоса - из 4 чередующихся красных и зеленых частей; посередине желтой части  воспроизведен малиновый, с желтыми глазами, клювом и лапами орел с распростертыми крыльями, держащий в клюве черную змею и стоящий на бело-черной полосе.

Обоснование символики: 
Флаг символизирует историко-географические и экономико-политические особенности Сковородинского района. 
История города Сковородино и всего Сковородинского района начинается в далеком 1650 году, когда известный землепроходец Ерофей Хабаров (в честь которого назван главный город Хабаровского края - Хабаровск, а также железнодорожная станция «Ерофей Павлович», расположенная на территории Сковородинского района) основал острог Албазинский. 
Этот острог (затем крепость Аблазин, в настоящее время село Албазино Сковородинского района), в честь заслуг по охране этих мест от внешних врагов получил в 1682 году печать, на которой был изображен орел со стрелами и луком. 
На современном флаге орел изображен побеждающим змею, которая в российской символике связана с образом неправедной силы. Малиновый орел на гербе символизирует благородство происхождения, древность, поскольку Сковородинский район - одно из первых мест в Амурской области освоенное русскими переселенцами. 
Змея на гербе несет дополнительную смысловую нагрузку, гласно указывая на первоначальное название центра района – поселок Змеиный. 
Узкая оконечность из зелени и красного (традиционные цвета пограничного столба) символизирует расположение района на границе с Китаем (пограничный переход в селе Джалинда). Черно-белый пояс (традиционное изображение железной дороги на картах и схемах) символизирует железнодорожные магистрали пересекающие район с запада на восток (Транссибирская магистраль)  и с севера на юг (Дальневосточная железная дорога). 
Богатство здешнего края, в котором выделяется Верхне-Приамурская золото-молибденовая зона, отражены на флаге желтым полем щита. 
Желтый цвет – символ высшей ценности, величия, великодушия, богатства, солнечного света. 
Черный цвет символизирует благоразумие, мудрость, скромность. 
Белый цвет – символ чистоты, света, добра. 
Красный цвет – символ мужества, решимости, трудолюбия, жизнеутверждающей силы и красоты. 
Зеленый цвет символизирует здоровье, природу, сельское хозяйство.