Флаг города Когалым Ханты-Мансийского АО-Югра представляет собой прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, разделенное по горизонтали на две равновеликие части - синюю и зеленую; одна пятая часть полотнища у древка выделена в виде чередующихся вертикальных полос - трех белых и двух синих, при этом синие полосы вдвое шире белых.
Символика флага города воспроизводит символику герба города в сокращенном виде.